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刘小乐教授发布癌症综合分析法(分析法与综合法的区别)

佚名 2024-06-06 04:27:22

刘小乐教授发布癌症综合分析法

2016年08月25日讯 理解肿瘤与免疫系统的相互作用,是发现预后指标、降低药物抗性和开发新药的关键。为此,哈佛大学的研究人员开发了一种能够综合性分析肿瘤免疫的计算方法。该方法可以对肿瘤浸润免疫细胞进行评估,帮助人们理解癌症中的肿瘤-免疫互作。

研究人员将自己的算法用于癌症基因组图谱TCGA的一万多个RNA-seq样本,涉及23种癌症。他们评估了不同肿瘤的免疫浸润水平,分析了肿瘤浸润免疫细胞的临床关联,还预测了新的治疗靶标。

研究显示,MAGEA3是黑色素瘤的潜在免疫靶标,但它不适用于非小细胞肺癌。在许多癌症中,SPAG5可以成为癌症疫苗的靶标。研究还表明,根据CD8 T细胞的浸润情况,可以将高水平表达CTLA4的黑色素瘤分为两类。这些数据可以帮助人们开发出更有效的癌症疫苗和检验点阻断疗法。

刘小乐教授青年时代就读于天津南开中学, 1992 年考入北京大学生物系。1994 年转学到美国史密斯女子学院 (Smith College) 双修生物化学和计算机科学, 三年后以最高拉丁荣誉毕业 (Summa Cum Laude, 授予全校积分最高的 1% 的毕业生)。2002 年于斯坦福大学取得生物医学信息学博士和计算机科学辅修博士学位后, 被直接聘为哈佛大学终身制助理教授。她目前担任哈佛大学公共卫生学院生物统计与计算生物学系的终身正教授、Dana-Farber 肿瘤研究所功能性癌症表观遗传组学中心主任, 和同济大学生物信息学系教授并长江学者讲座教授。

刘小乐教授带领的研究小组最近在国际著名学术期刊上发表了多项研究成果。五月三十日在Nature Genetics杂志上发布了一种新的计算方法,该方法可以帮助人们用RNA-seq数据从头组装肿瘤浸润T细胞的CDR3序列。肿瘤浸润T细胞是从血液进入肿瘤的淋巴细胞。肿瘤浸润T细胞大量存在,说明机体启动了对抗肿瘤的免疫反应。

高通量实验中的噪音和偏好使高维基因组数据分析成为了一项很大的挑战。刘小乐教授与和德克萨斯大学西南医学中心合作对此进行了深入研究。他们开发了一种强大的计算方法--MANCIE,并将其发表在今年四月的Nature Communications杂志上。

刘小乐教授此前还在《NATURE REVIEWS GENETICS》上发表文章,探讨了NGS染色质分析出现偏好的常见原因、如何判断这些偏好、减少偏好对结论的影响。这篇综述以DNA为中心,总结了NGS染色质分析中最重要的经验教训,提出了一些解决偏好的分析策略。

分析法与综合法的区别

分析法和综合法区别如下
1、综合法是把经济现象的各个部分、各个方面和各种因素联系起来,从总体上认识和把握经济现象的方法。以综合法解应用题时,先选择两个已知数量,并通过这两个已知数量解出一个问题,然后将这个解出的问题作为一个新的已知条件,与其它已知条件配合,再解出一个问题,一直到解出应用题所求解的未知数量。
2、分析法是把复杂的经济现象分解成许多简单组成部分,分别进行研究的方法。用分析法解题时如果解题所需要的两个条件,(或其中一个条件)是未知的时候,就要分别求解找出这两个(或一个)的条件,一直到问题都是已知的时候为止。

在解决实际问题时常用的分析方法有哪些

目前在实际工作中,通常采用的分析方法有五种:

1、对比分析法

也叫比较分析法,是通过实际数与基数的对比来提示实际数与基数之间的差异,借以了解经济活动的成绩和问题的一种分析方法。在科学探究活动中,常常用到对比分析法,这种分析法与等效替代法相似。对比法, 戏剧常用的一种主要艺术手法。一般有三种对比:人物对比、场面对比、细节对比。

2、因素分析法

又称经验分析法,是一种定性分析方法。该方法主要指根据价值工程对象选择应考虑的各种因素,凭借分析人员的知识和经验集体研究确定选择对象。该方法简单易行,要求价值工程人员对产品熟悉,经验丰富,在研究对象彼此相差较大或时间紧迫的情况下比较适用,缺点是无定量分析、主观影响大。

因素分析法是利用统计指数体系分析现象总变动中各个因素影响程度的一种统计分析方法,包括连环替代法、差额分析法、指标分解法等。 因素分析法是现代统计学中一种重要而实用的方法,它是多元统计分析的一个分支。使用这种方法能够使研究者把一组反映事物性质、状态、特点等的变量简化为少数几个能够反映出事物内在联系的、固有的、决定事物本质特征的因素。

因素分析法的最大功用,就是运用数学方法对可观测的事物在发展中所表现出的外部特征和联系进行由表及里、由此及彼、去粗取精、去伪存真的处理,从而得出客观事物普遍本质的概括。其次,使用因素分析法可以使复杂的研究课题大为简化,并保持其基本的信息量。

3、相关分析法

揭示某一矿区钻孔自然弯曲趋势的另一方法是进行相关分析,又称回归分析,即利用数理统计原理,求出反映钻孔自然弯曲趋势的回归方程。通常设孔深为自变量,顶角和方位角为因变量,建立相关关系式这两个相关关系式就代表钻孔顶角和钻孔方位角随孔深而变化的规律。

4、差额计算法

确定引起某个经济指标变动的各个因素的影响程度的一种计算方法。与"连续替代法"内容相同。在几个相互联系的因素共同影响着某一个经济指标的情况下,可应用这一方法计算各个因素对该经济指标发生变动的影响程度。在衡量某一因素对于一个经济指标的影响时,假定只有这一因素变动,而其余因素不变。确定各个因素替代顺序,然后按照这一顺序进行替代计算。这种方法是假定各个因素依照一定的顺序发生变动而进行替代计算的, 因此分析出来的结果具有一定程度的假定性。

5、比例法

比例法亦称“间接计算法”。它是利用过去两个相关经济指标之间长期形成的稳定比率来推算确定计划期有关指标的一种方法。

扩展资料

分析法是“综合法”的对称。把复杂的经济现象分解成许多简单组成部分,分别进行研究的方法。其实质是: 通过调查研究,找出事物的内在矛盾,并对矛盾的各个方面进行深入研究。剔除那些偶然的、非本质的东西,抽象出必然的、本质的因素,并由此得出一些反映本质的简单规定,以把握矛盾的各个方面的特殊性。

分析法所提供的只是对于经济现象的片面理解,它还不能从总体上、从各个部分之间的相互联系上来把握经济现象。因此,在分析的基础上,还必须运用综合的方法,使分析得到的各个方面的本质规定,按照经济现象内在的逻辑联系,形成有机的体系,这样才能全面、深刻地认识经济现象,提出解决问题的有效办法。

适用范围:不易直接证明结论;从结论很显然能推出明显正确的条件。

参考资料:百度百科-分析法

本文地址:http://dadaojiayuan.com/jiankang/302999.html.

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