中药复方研究的计算机辅助药物设计技术

中药复方研究的计算机辅助药物设计技术

中药复方是一复杂的分子体系，在制剂过程中药物之间的不同组分也随着复杂的物理和化学变化，可能形成各种复合物，从而导致中药及复方具有多靶酶、多靶点、多环节作用的特点。随着信息时代的到来，计算机辅助药物设计在药物设计研究中得到广泛的应用，因此不妨将计算机辅助药物设计移植于中药复方的研究领域，将中药配伍规律和作用机制的研究载入一个虚拟的世界，可能为探讨中药防治疾病的现代科学依据拓展一个崭新的空间。

为药物设计开辟虚拟空间

计算机辅助药物设计依据对分子理化性质如分子极性、所带电荷、水溶性和分配系数等参数的计算分析，可以在计算机上方便快捷地建造、分析和修改分子结构并利用三维技术实时显示其立体结构，计算分子能量和立体化学性质及物理化学性质，推算出各种低能构象，进行构象分析并与酶模型相结合，对药物分子进行定量设计，并利用系统软件对候选物结构进行优化，由此推断其活性构象，设计新的药物分子。计算机系统根据软药原理对先导化合物进行结构改造，获得候选化合物，通过系统软件对分子的理化参数进行分析，确立筛选依据，获得安全有效的药物分子。

有望阐明中药复方作用机制

中药复方是由多味中药配伍在一起，共同起到各单味药所不能起到的作用。中药复方配伍的化学成分不是各单味药化学成分的简单相加，其疗效也不是各单味药的简单叠加，复方通过药物成分间发生协同、制约或改性等作用来达到减毒增效的目的。阐明复方配伍的化学物质成分以及多靶点效应机制，是突破中药研发现状的关键环节之一，也是解决中药与国际医药发展趋势接轨问题的必经之路。随着x射线衍射以及核磁共振等技术的发展，越来越多的生物大分子的三维结构被测定出来，使基于受体结构的计算机辅助药物设计具现实意义，分子对接方法可谓其中的重中之重。分子对接法是基于受体大分子三维结构来寻找先导化合物的重要方法，就是两个或多个分子之间通过几何匹配和能量匹配而相互识别的过程，也是计算机辅助药物分子设计中最为重要的方法之一，为中药研究提供了新思路和新方法。

在机体内药物分子与受体充分接近，在必要的部位相互契合、相互作用后，可通过适当的构象调整，得到一个稳定的复合物构象，这是药物分子产生药效反应的重要过程。生物大分子和药物小分子的各种表面性质，可用分子对接法来计算。对接计算时，将配体分子放到受体活性位点，然后按照几何互补、能量互补以及化学环境互补的原则来实时评价配体与受体相互作用的好坏，并找到两个分子之间最佳的结合模式。通过分子对接法确定复合物中两个分子正确的相对位置和取向，研究两个分子的构象特别是底物构象在形成复合物过程中的变化，是确定药物作用机制、设计新药的基础。由于中药复方的有效成分多为小分子物质，因此借助计算机辅助药物设计的分子对接法可阐明中药复方作用机制，这可能是连接传统中药学与现代科学的纽带。

在中药新药研发中的意义

用计算机辅助药物设计的分子对接法研究中药化学成分与靶酶的相互作用，分析中药多靶点机制更直观、明确，可使复方从单味药组方进入活性物质配伍研究的新层面。虽然这只是计算机模拟技术，但却具有很强的理论性和科学性。利用计算机模拟方法探讨中药的作用机制，不仅可以弥补动物药理实验方法的缺陷，也减少了人力和物力的投入，更重要的是在中药新药研究领域，建立了全新的理念和先进的研究手段，有望使中药现代化真正跨入一个宽广的良性发展的轨道。

中药组分为何成为中药新药开发辅助设计的“及时雨”?

有提高新药开发效率、创新新药研发、降低新药开发成本的原因。
1、中药复方中的药物成分已经经过长期的临床应用和研究，具有一定的药效和安全性，可以为新药的开发提供先验知识，缩短开发周期和降低开发风险。
2、中药复方中的药物成分具有多种作用，可以用于发现新的治疗靶点，开发新的药物，提高新药的疗效和安全性。
3、中药复方中的药物成分已经经过长期的临床应用和研究，可以节省新药开发的时间和费用，降低开发成本。

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生物化学与分子生物学学科简介
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日趋合理的学术梯队。现有学科的教学和科研人员10人，其中教授3人（博士生导师），副教授，具有博士学位的教师达68％。有10名研究生，硕士研究生，博士毕业生。
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的作用日益显着。这个主题已经被发表在科学出版学术专着，发表学术论文60余篇，主持了11项国家和省部级科研资金600万美元。
电话：82190259
关于金博士
药房药学学科国家重点学科 - 东北林业大学植物学基础，依托森林植物生态学，教育部，国务院学位办公室教育在2003年批准成立的第一个主要的学科 - 制药实验室，制药学科的空白，以填补我的学校，学校向学生敞开了大门，2004年，为学校的建设成为一个多学科，多类综合性大学，起到了积极的作用。经过多年的建设和发展本学科的药材，包括GAP种植的植物中的有效成分，有效分离，结构修饰的植物活性成分，植物活性成分，高通量筛选的植物资源，有效利用研究小组提出了一系列创新性成果，并获得了中国传统医学重点实验室，黑龙江省（2004年批准），林业，生物制剂，工程教育研究中心，教育部，教育部批准（2006年），并于2006年荣获黑龙江省重点学科，以及小型和中型的企业在黑龙江省的普通技术人员，以促进研究和开发中心，2007年，第二批。药剂合理的学科的学术梯队，汇集到一起的组合，其中大部分是中年和青年教师，博士生导师，教授，副教授，讲师，助教。 45个文件，其中包括14篇SCI论文，EI收录6，已培训了15名研究生和研究生供不应求，就业率达到100％。
学科三个主要的研究方向。该方向的研究药用植物资源，中国传统中药资源保护和再生的中国中药材及中药材质量评价研究的真实性。第二个研究方向：中国传统医药的研究和开发，主要用于基础研究和应用研究，中国传统医药和活性成分，在中国，中国中药标准化及质量标准的研究质量评估。研究方向：天然活性成分和结构的变化，包括它们的活性，将所得的化合物具有一个新的结构，或具有生物活性的单体的提取，提取和分离的条件下，结构鉴定，对象的一般活动和目的，创新药物，天然活性化合物，铅化合物，合成一系列结构类似物的结构 - 活性关系的研究的效率和低的毒性。结合
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药物MA
药物MA是在学校的主要议题之一，依靠森林植物生态学，生物医药产业的个人实验室，教育和林业重点学科，教育部金融教育厅工程技术研究中心，从2007年招收研究生的学科，教授，副教授，17个博士后经验，博士20（3）国外学历，7个博士后研究人员在美国，现有博士生导师在美国，德国，英国和其他的美德，政府补贴和凝聚力的大多数国家，以获得合理的学术梯队，学术，具有博士学位和经验，进一步研究和实质性的学术交流和合作关系的日本外交的骨干。在过去的五年中，国际期刊和会议论文200余篇，申报专利10余项，出版专着7个国家科学技术发明奖二等奖，国家科学技术进步奖，省，市科学和技术科学出版科技进步奖和技术发明奖的学科，承担国际合作项目和项目在这三个国家的德国，和中国国家自然科学基金，省部级项目6，七横的问题，已经积累了丰富的经验，研究和实践经验，及时教学，教学和科研有机地结合起来，相互促进，培养了一批高素质的人才队伍，发挥了一定的作用，通过教学和科研工作。
发展的跨学科研究的特点和应用前景的天然产物药物在中国传统医学在中国几千年多年的历史，有着深厚的中医临床基础正在寻找创新药物体力活动前的跟踪和铅化合物，铅化合物材料基础上的自然活跃的物质，在人体的新陈代谢，为了以澄清该药物的来源在中国，组合化学，计算机，计算机辅助药物设计和目标的互动计算平台的评价，新设计的小分子导致复合，利用现代科学和技术及发现的药品和创新药品到中国的自己的知识产权财产权利和财产权利的发展结构修饰，利用现代生物技术方法进行了天然药物和机制行动，他们的目标开发新的药物，并奠定了坚实的理论基础。实验组合化学，计算机辅助药物设计和分子生物学平台的目标，一直从事的工作经验的人员从事研究生产力体验长期的合作研究，研究，林业和生物制品工程技术研究中心，教育部社会服务，与国内著名科研机构。
联系人：李医生轻拥82192336

基于配体结构的计算机辅助药物分子设计有哪些研究内容和方法

基于配体结构的计算机辅助药物分子设计可以按照要求。

基于配体的药物分子设计，既可以用于药物虚拟筛选，也可以用于反向寻靶，譬如药物筛选管理系统（DSMS），基于二维或三维相似度等手段，进行虚拟筛选；又譬如药物靶点预测系统（DTPS），基于相似度进行靶点预测。

扩展资料：

计算机辅助药物设计的一般原理是，首先通过X－单晶衍射技等技术获得受体大分子结合部位的结构，并且采用分子模拟软件分析结合部位的结构性质，如静电场、疏水场、氢键作用位点分布等信息。

然后再运用数据库搜寻或者全新药物分子设计技术，识别得到分子形状和理化性质与受体作用位点相匹配的分子，合成并测试这些 分子的生物活性，经过几轮循环，即可以发现新的先导化合物。因此，计算机辅助药物设计大致包括活性位点分析法、数据库搜寻、全新药物设计。

-计算机辅助药物设计

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